با تشديد بحران درونی رژيم و بالاگرفتن مخاصمات مجلس شورای اسلامی با احمدی نژاد، خامنه ای خطاب به نمايندگان مجلس گفت: متوجه باشيد که شما از پشت بلندگويی حرف می زنيد و لازم است از تعرض به ديگران، بيان اتهاماتی که ثابت نشده است و طرح مسائل خصوصی افراد به شدت پرهيز کنيد.
خامنه ای با اشاره به تصميم لاريجانی برای مقابله با احمدی نژاد، گفت: نبايد به اسم استقلال مجلس، درباره هر مسئله ای به دولت متعرض شد
خامنه ای در بخش ديگری از اظهارات خود با ابراز نگرانی از پيامد تحولات منطقه، گفت: مجلس بايد در حوادث و مسائل داخلی و خارجی، مواضع مشخصی داشته باشد. امروز در منطقه غوغايی است و در اين منطقه مهم که قلب دنيا به شمار می رود، اوضاع عجيبی حاکم شده است. برخی با گوشه و کنايه می گويند دنيا را در مقابل نظام قرار ندهيد اما اين، سخنی از سر نينديشيدن است.