در این گفت‌وگو، علی یونسی «فعالیت‌های موازی اطلاعاتی» را «برای امنیت ملی ایران خطرناک» توصیف کرده و گفته است که حکایت فعالیت‌های موازی اطلاعاتی «مثل خلبانی است که امنیت هواپیما را عهده دار باشــد و از سوی دو برج مراقبت فرمان بگیرد در حالی که باید نظارت از یک برج مراقبت باشد.»

علی یونسی با اشاره به وجود سازمان‌های نظامی و اطلاعاتی مختلف در جمهوری اسلامی گفته است که این سازمان‌ها «در محدوده کار خودشان مطابق قانون اختیار دارند و این مشمول همه سازمان‌های نظامی اطلاعاتی است، اما نباید در کار وزارت اطلاعات دخالت کنند، و وزارت اطلاعات هم نباید در کار آنها دخالت کند.»

دستیار حسن روحانی در عین حال تاکید کرده است که «امنیت ملی خارج از محدوده‌های نظامــی و انتظامی صددرصد در اختیار وزارت اطلاعات است.»

روزنامه فرهیختگان همچنین از قول علی یونسی نوشته است: «محمود علوی وزیر اطلاعات رییس شورای هماهنگی سازمان های اطلاعاتی- امنیتی است، و اگر همه به قانون تن دهند، از موازی کاری جلوگیری می‌شود.»

وزیر اطلاعات دوره ریاست جمهوری محمد خاتمی همچنین «مهمترین مشکل» فعلی وزارت اطلاعات جمهوری اسلامی را «جلب اعتماد عمومی» عنوان کرده و گفته است: «وزارت اطلاعات فقط هدفش امنیت نظام نیست؛ بلکه مسئول امنیت مردم هم هست» و نباید «هیچ استثنایی هم برای هیچ کس قائل شود و مسلمان و غیرمسلمان عضو هر حزب و گروه که باشد همین که ایرانی است وزارت اطلاعات باید در تامین امنیت همه آنها مساوی عمل کند.»

علی یونسی درباره سه مطالبه اصلی رای دهندگان به حسن روحانی درباره «حل مشکل هسته‌ای، بهبود وضع اقتصادی و باز شدن فضای سیاسی اجتماعی و به طور مشخص رفع مساله محصورین» گفته است: «هر سه مورد به طور نسبی محقق شده است؛در خصوص روند پیگیری مساله هسته‌ای در مدت ۱۰۰ روز دولت توانست وضع گذشته را متوقف کند و دیوار سخت تحریم را ترک بیندازد و شرایط را تغییر دهد. در حوزه اقتصادی امید ایجاد شده و نرخ تورم رو به تنزل است و در زمینه کسب و کار هم شرایط بهتر شده است، و همچنین در حوزه فضای باز سیاسی اجتماعی هم این اتفاق به طور نسبی افتاده است.»

دستیار ر‌یس جمهوری اسلامی تاکید کرده است که اقدامات دولت یازدهم درباره هر سه مطالبه اصلی رای دهندگان به حسن روحانی «عملیاتی شده و کامل‌تر هم می‌شود»، و برای نمونه درباره باز شدن فضای سیاسی اجتماعی به روزنامه فرهیختگان گفته است: «قبلا اسامی برخی از آقایان شاخص اصلاح طلب را نمی‌توانستید ببرید.»

در پاسخ به پرسش مرجان طباطبایی خبرنگار روزنامه فرهیختگان درباره اینکه چرا هنوز «آزادی زندانیان سیاسی و رفع حصر صورت نگرفته است»، علی یونسی گفته است: «عجله می‌کنید. فضا هنوز به آن اطمینان نرسیده است و این مساله تابع جو کلان است. یعنی باید فضای جامعه به گونه‌ای باشــد که هیچ کس احساس نگرانی نکند. نه حکومت و نه دولت احساس نگرانی نکنند، و گذشت زمان این را ثابت می‌کند، و به هر حال مراحل باز شدن فضای اجتماعی سیاسی زمان می‌برد.»